音乐系是内蒙古科尔沁艺术职业学院主干专业，它包括声乐专业和器乐专业（器乐含民乐：三弦、四胡、马头琴、扬琴、民族打击乐、竹笛、古筝；西洋乐：钢琴、手风琴、大提琴、小提琴、小号、单簧管、西洋打击乐、长笛、萨克斯等）。该专业设中专、大专、本科三个学历层次，纳入国家统招计划，常年招生。
　　师资力量雄厚：音乐系在学院已有近三十年的历史。长期的教学实践，培养和造就了一批较丰富的教学经验和严谨的教学风格的教师队伍。教学全部由讲师以上职称的教师承担。教学效果显著。该系每年都有相当数量的毕业生以优异的成绩考入高等院校深造，输送到省（部）、国家级文艺团体，好多已成为艺术战线上的骨干。该系师生多次在国家、省（部）级大赛中获奖，留学乌克兰，出访日本、韩国、东南亚、法国等国家和地区。
　　音乐系的培养目标：培养具有音乐理论和较高的表演和演奏技能的专门人才。